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Protéomique chimique : cisplatine

[Article collaboratif] | Utiliser une stratégie de protéomique chimique pour dévoiler le réseau de protéines cibles du cisplatine et améliorer la compréhension de son mécanisme anticancéreux

Grâce aux progrès rapides de la médecine moderne, des avancées significatives ont été réalisées dans la recherche et le développement de médicaments anticancéreux. Parmi ceux-ci, le cisplatine se distingue par sa puissante efficacité antitumorale dans le traitement de diverses tumeurs solides, servant de lueur d’espoir pour de nombreux patients atteints de cancer. Malgré son utilisation clinique répandue, la compréhension des mécanismes internes de l’action du cisplatine reste un sujet central activement poursuivi par la communauté scientifique. Dans ce contexte, une équipe de recherche du Tongji College of Pharmacy, de l'Université des sciences et technologies de Huazhong, a publié un article intitulé « Molecular Targets of Cisplatin in HeLa Cells Explored Through Competitive Activity-Based Protein Profiling Strategy » dans le Journal of Inorganic Biochemistry ( Facteur d'impact 3,9). Tirant parti de la technologie d’analyse protéomique chimique compétitive basée sur des sondes spécifiques à la cystéine (ABPP compétitif), l’étude identifie avec précision les cibles du cisplatine et leurs sites d’action dans les cellules HeLa.

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Grâce aux progrès rapides de la médecine moderne, des avancées significatives ont été réalisées dans la recherche et le développement de médicaments anticancéreux. Parmi ceux-ci, le cisplatine se distingue par sa puissante efficacité antitumorale dans le traitement de diverses tumeurs solides, servant de lueur d’espoir pour de nombreux patients atteints de cancer. Malgré son utilisation clinique répandue, la compréhension des mécanismes internes de l’action du cisplatine reste un sujet central activement poursuivi par la communauté scientifique. Dans ce contexte, une équipe de recherche du Tongji College of Pharmacy, de l'Université des sciences et technologies de Huazhong, a publié un article intitulé « Molecular Targets of Cisplatin in HeLa Cells Explored Through Competitive Activity-Based Protein Profiling Strategy » dans le Journal of Inorganic Biochemistry ( Facteur d'impact 3,9). Tirant parti de la technologie d’analyse protéomique chimique compétitive basée sur des sondes spécifiques à la cystéine (ABPP compétitif), l’étude identifie avec précision les cibles du cisplatine et leurs sites d’action dans les cellules HeLa.

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Une méthode compétitive de profilage de la cystéine a été utilisée pour identifier la cystéine se liant au cisplatine dans les protéomes des cellules HeLa à l'aide de la sonde desthiobiotine iodoacétamide.

Dans cet article, Chomix a fourni un soutien expert dans la préparation d’échantillons de protéomique chimique et dans l’identification et l’analyse par spectrométrie de masse pendant le processus de découverte de cibles. Tirant parti d'un équipement de spectrométrie de masse à haute résolution et de la technologie de protéomique chimique, les échantillons de cellules HeLa traitées au cisplatine ont subi une série d'analyses comprenant le marquage par sonde réactive à la cystéine (DBI), la séparation par précipitation des protéines, la digestion par la trypsine, le marquage isotopique, l'enrichissement en peptides marqués par la sonde, et LC-MS/MS. Cette approche globale a permis d'identifier 3 571 peptides, correspondant à 1 871 protéines, dont 46 protéines identifiées comme cibles potentielles du cisplatine. Ces protéines cibles sont principalement associées au métabolisme du folate, à la désubiquitination des protéines, à la synthèse de la tétrahydrobioptérine, au métabolisme du tétrahydrofolate et à d'autres voies. Le service professionnel d'identification de cibles de Chomix garantit la fiabilité et l'exactitude des données, améliorant considérablement la crédibilité et la valeur scientifique des résultats de recherche.

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Figure 2 : Analyse fonctionnelle des protéines cibles du cisplatine

Outre la préparation d'échantillons par protéomique chimique et l'identification par spectrométrie de masse, les services d'identification de cibles fournis par Chomix incluent également l'identification des sites de liaison médicament-protéine, ce qui est crucial pour révéler le mécanisme d'action des médicaments. Pour valider davantage l'effet de liaison entre le cisplatine et ses cibles protéiques nouvellement découvertes, le CAPN 1 de haute confiance a été choisi pour validation. La protéine a été incubée avec du cisplatine dans un rapport molaire de 1:10, et un nouveau pic de produit a été observé en plus du pic de masse d'origine de la protéine, la différence de masse correspondant à celle de 10 molécules de cisplatine. Ce résultat démontre clairement l'interaction entre CAPN 1 et le cisplatine. Des études antérieures ont montré que l'apoptose induite par le cisplatine dans les cellules HeLa est inhibée, indiquant une corrélation positive entre la protéine et l'activité antitumorale du cisplatine. Cette étude fournit de nouvelles informations pour explorer davantage le mécanisme d’action et la toxicité du cisplatine.

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Figure 3 : Avant et après la réaction entre la protéine CAPN 1 et le cisplatine.

En résumé, cet article élucide avec succès les cibles du cisplatine dans les cellules HeLa à l’aide de la méthode Competitive ABPP, identifiant la nouvelle cible CAPN 1. Cette découverte fournit des informations cruciales sur les mécanismes sous-jacents à l’action et à la toxicité du cisplatine. Non seulement cette étude enrichit notre compréhension du mécanisme d’action du cisplatine, mais elle constitue également un outil puissant pour les futurs projets de recherche dans ce domaine.

Note spéciale : cet article a participé au « ChomiX Paper Publication Award Program » et a reçu un généreux prix de Chomix. Nous invitons chaleureusement davantage de chercheurs à rejoindre le « ChomiX Paper Publication Award Program ». En reconnaissant les produits ou services ChomiX (par exemple, « Nous remercions ChomiX Biotech Co., Ltd. (Nanjing, Chine) pour sa contribution inestimable à nos expériences de protéomique chimique. »), les chercheurs peuvent potentiellement participer à ce programme d'incitation, favorisant l'innovation et facilitant l’échange des résultats de la recherche. Chomix reste déterminé à être un partenaire fidèle de la communauté de la recherche scientifique, promouvant activement le progrès scientifique mondial et collaborant à la recherche de pointe sur les mécanismes d'action des médicaments. Nous prévoyons avec impatience de collaborer avec davantage d’équipes de recherche scientifique pour ouvrir la voie à une nouvelle ère de découverte scientifique.