En tant que technologie de base dans la recherche biomédicale moderne, l’analyse qualitative et quantitative des protéines, soutenue par le développement rapide de la technologie de spectrométrie de masse, a permis une identification et une quantification précises des protéines. Cette technologie joue un rôle central en révélant les mystères des phénomènes vitaux, en explorant les mécanismes des maladies et en découvrant des biomarqueurs. Actuellement, il est largement utilisé dans divers domaines :
Exploration des mécanismes biologiques : l'analyse qualitative des protéines identifie avec précision la présence et l'identité de protéines spécifiques dans les échantillons, révélant ainsi la composition protéique des cellules, des tissus ou des organes, approfondissant ainsi la compréhension des bases moléculaires des processus vitaux, tels que les mécanismes de transduction du signal, la régulation métabolique. réseaux et régulation du cycle cellulaire.
Diagnostic et traitement des maladies : des niveaux d'expression anormaux de protéines sont souvent associés à l'apparition et au développement de diverses maladies. Grâce à l'analyse qualitative et quantitative des protéines présentes dans le liquide céphalo-rachidien, le sang ou d'autres fluides corporels, les scientifiques peuvent découvrir et valider des biomarqueurs potentiels pour le diagnostic précoce de la maladie, l'évaluation du pronostic et le suivi thérapeutique.
Recherche en génomique fonctionnelle : combinée aux données sur l'expression des gènes, l'analyse quantitative des protéines aide à établir le lien entre l'expression des gènes et l'abondance des protéines, validant ainsi la fonction des gènes et acquérant une compréhension plus approfondie des réseaux de régulation de l'expression des gènes.
Médecine personnalisée et thérapie de précision : basée sur des informations qualitatives et quantitatives issues de la protéomique, une analyse précise des différences individuelles chez les patients fournit une base pour développer des plans de traitement personnalisés.
Avec le développement et l’application de la technologie de séquençage à haut débit et de la spectrométrie de masse, la précision et la couverture de l’analyse différentielle des protéines ont été considérablement améliorées. Cela permet aux chercheurs d’explorer en profondeur et d’évaluer méticuleusement les cibles potentielles des médicaments dans la progression de la maladie sur la base de données massives.
La protéomique ciblée se concentre sur la recherche approfondie de protéines cibles prédéfinies, tandis que la protéomique non ciblée vise à détecter de manière exhaustive toutes les protéines dans les échantillons, dans le but de découvrir des types de protéines inconnus et des biomarqueurs potentiels, également connus sous le nom de protéomique de découverte. La protéomique non ciblée s'est développée plus tôt que la protéomique ciblée et est particulièrement adaptée à la phase initiale de l'exploration des biomarqueurs.
L’analyse de quantification absolue des peptides est un moyen technique important pour déterminer les changements dans les niveaux d’expression des protéines en protéomique. Par rapport aux techniques traditionnelles d’immunotransfert, l’analyse quantitative basée sur la spectrométrie de masse offre une spécificité plus élevée, particulièrement adaptée à l’analyse quantitative des isoformes protéiques. Cette technologie peut détecter et analyser simultanément plusieurs protéines, combinées à des peptides marqués par des isotopes, permettant ainsi une mesure précise de l'abondance des protéines.