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Produits

Profilage à l'échelle du protéome pour les médicaments contre la dégradation ciblée des protéines (TPD)

Caractéristiques techniques de la plateforme

Le médicament PROTAC (Proteolysis Targeting Chimeras) est une molécule bifonctionnelle qui peut se lier à la protéine ciblée et recruter l’ubiquitine E3 ligase pour la dégradation. Par conséquent, de nouvelles modalités telles que PROTAC et la colle moléculaire ont la capacité de modifier par inadvertance l’abondance des protéines endogènes, ce qui constitue une nouvelle méthode thérapeutique pour les cibles protéiques, en particulier les protéines non médicamentables. La quantification complète de l’abondance des protéines cibles et non ciblées a été l’une des expériences standards pour la R&D sur les médicaments TPD.

Flux de travail

La plate-forme suit un flux de travail structuré, commençant par l'extraction du lysat cellulaire, effectuant ensuite la digestion par la protéase, le marquage isotopique et se terminant par la détection par spectrométrie de masse.

Étude de cas

Objectif du projet

Deux molécules PROTAC ont été conçues et synthétisées. Les protéines cibles et hors cible doivent être analysées pour comparer la sélectivité.

Méthode expérimentale

La méthode MS quantitative basée sur le TMT a été utilisée pour l'analyse protéomique.

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Un total de 5900 protéines ont été quantifiées dans les lignées de cellules tumorales et des cibles ON & OFF ont été identifiées pour PROTAC1 et 2 molécules (spectromètre de masse Orbitrap Exploris 480, TMT10plex et analyse des données par PD 2.5)

Offre de services

Analyse chimioprotéomique quantitative basée sur le TMT ou le DIA
Validation de la cible par PRM ou Western Blot


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