WechatIMG48

Produkty

Profilowanie całego proteomu pod kątem leków ukierunkowanych na degradację białek (TPD).

Funkcje techniczne platformy

Lek Chimery ukierunkowane na proteolizę (PROTAC) to dwufunkcyjna cząsteczka, która może wiązać się z docelowym białkiem i rekrutować ligazę ubikwitynową E3 do degradacji. Dlatego nowe metody, takie jak PROTAC i klej molekularny, mogą w sposób niezamierzony zmieniać liczebność endogennych białek, co zapewnia nową metodę terapeutyczną w przypadku docelowych białek, zwłaszcza białek niepodlegających lekowi. Kompleksowe ilościowe określenie obfitości białek docelowych i poza nimi jest jednym ze standardowych eksperymentów w ramach prac badawczo-rozwojowych nad lekami TPD.

Przebieg pracy

Platforma realizuje zorganizowany proces, rozpoczynający się od ekstrakcji lizatu komórkowego, następnie trawienia proteazą, znakowania izotopowego, a kończąc na detekcji spektrometrią mas.

Studium przypadku

Cel projektu

Zaprojektowano i zsyntetyzowano dwie cząsteczki PROTAC. Należy przeanalizować białka docelowe i pozacelowe w celu porównania selektywności.

Metoda eksperymentalna

Do analizy proteomicznej wykorzystano ilościową metodę MS opartą na TMT.

微信图片_20230927154303

Ogółem oznaczono ilościowo 5900 białek w liniach komórek nowotworowych oraz zidentyfikowano cele ON i OFF dla cząsteczek PROTAC1 i 2 (spektrometr mas Orbitrap Exploris 480, TMT10plex i analiza danych za pomocą PD 2.5).

Oferta usług

Ilościowa analiza chemoproteomiczna oparta na TMT lub DIA
Walidacja celu metodą PRM lub Western Blot


  • Poprzedni:
  • Następny:

  • Napisz tutaj swoją wiadomość i wyślij ją do nas